Cuando me he encontrado con un PDF protegido, nunca he tenido problemas en abrirlo con Evince y poder copiar parte de su contenido si tenía necesidad. Sin embargo, si tengo que trabajar sobre Microsoft Windows por razones laborales, académicas o por gusto, con el lector que usa la mayoría de los usuarios, Adobe Reader, como es mi caso, los documentos sí se encuentran protegidos y es imposible copiarlos.

Para este tipo de circunstancias, os recomiendo que uséis una herramienta en línea, que de manera totalmente gratuita desprotege el documento en cuestión de segundos. Su nombre y el enlace a la misma están abajo:

Free PDF Unlock Online Utility